Les équipes de recherche prennent de plus en plus en considération l'aspect contractuel de leurs collaborations avec les entreprises. La politique générale du Cnam, concernant une collaboration de recherche entre un laboratoire et une entreprise, consiste à négocier la co-propriété des résultats. Dans certains cas particuliers, le Cnam peut accepter de laisser l'entière propriété des résultats à l'entreprise, en contrepartie d'une compensation financière.

La direction de la recherche conseille et instruit tout ce qui concerne la protection intellectuelle jusqu'au dépôt : brevet, enveloppe Soleau, ainsi que les droits d'auteurs et les dépôts de marque.

Pour aider les équipes à trouver des partenaires et valoriser leurs brevets, le Cnam s'est rapproché des centres Relais Innovation qui font connaître les inventions dans leur réseau européen et organisent des conventions d'affaires. Dans le domaine de l'électrochimie, une négociation pour une cession de licence est en cours, une étape technique devant être validée. Le Cnam entretient des rapports également avec les Centres régionaux pour l'innovation et le transfert (Critt) et Oseo, pour obtenir des aides à la valorisation.